Команда chmod (change mode) используется в Linux для изменения прав доступа к файлам и каталогам. Она, являясь стандартной, присутствует во всех дистрибутивах Linux.
Утилита командной строки Linux grep даёт возможность найти текст в указанном файле. Можно также передать вывод любой команды в grep, что значительно упрощает поиск.
Команда find, предустановленная во всех дистрибутивах Linux, позволяет осуществлять поиск по имени, дате добавления, содержанию, а также с использованием регулярных выражений.
Визуально сравнить файлы и каталоги Linux помогает многофункциональная программа Meld. Возможна её интеграция с системами контроля версий: Git, Bazaar, Subversion и других.